El escudo de la Institución Educativa Aguabonita tiene forma octogonal. De susladossedesprende ocho triángulos de color verde que simbolizan cada una de las sedesquelaconforman. En el centro se encuentran dos manos entrelazadas que simbolizanlauniónyel trabajo en comunidad; alrededor se encuentra el lema “Sabiduría, Progreso, Cultura y Paz”,pilares que afirman y se convierten en la base de este trabajo unificado y colaborativo.
La bandera de la Institución Educativa Aguabonita hace parte de la identidad y el sentidodepertenencia. La bandera tiene forma rectangular dividida en tres franjas iguales, decoloresverde, blanco y azul. En la franja del medio se encuentra el escudo de la institución.